1、扣费方式不同。etc记账卡车辆在通过高速公路收费站时，系统根据通行记录在账户中扣除当次通行费。而储值卡是系统直接从卡内扣除当次通行费；2、预存通行费的方式不同。etc记账卡要求用户需在后台账户预存通行费，而储值卡是用户需在卡内预存通行费，如果储值卡内没有钱就不能通过高速收费站。
什么是ETC？
高速ETC直译为电子公路收费，就是我们常说的不停车收费系统，在高速公路设有一条或多条ETC车道，通过安装在前挡风玻璃上的ETC电子标签与收费站ETC车道上方的微波天线之间的微波专用短程通讯，再利用计算机联网技术与银行后台结算，达到车辆通过路桥不停车收费目的。而ETC设备上的ETC卡也就是一张银行卡，目前主要分为三类：
一、ETC记账卡
通过高速公路收费站时暂不用收费，电脑会显示录通行情况并记录，系统会自动分次从用户授权绑定的银行账户中扣除相应的费用，不用充值要按月还款，每次使用时候多支付1%的手续费。ETC记账卡与储值卡区别就是，ETC记账卡只能车主办理，而ETC储值卡办理人可以是个人、公司、车主。
二、ETC储值卡（借记卡）
也就是我们常说的B卡，这种ETC卡不具备透支消费功能，需提前预存费用（保证金）才能使用，当ETC储值卡余额不足时则不能通过ETC车道，还有可能被纳入ETC黑名单。
三、ETC信用卡
通常这种ETC信用卡联名通行卡，是与银行等金融机构合作发行，其集信用卡金融功能与通行卡CPU双界面智能芯片功能于一体，在公路收费站使用时等同通行卡，在金融消费领域使用时等同信用卡。
ETC记账卡和储值卡哪个好
总的来说，在ETC储值卡余额充足的情况下，ETC储值卡使用更加方便，免去ETC记账卡还款等手续，ETC储值卡充值却比较麻烦。而ETC记账卡则不用担心余额问题，对经常跑高速的朋友非常适用，但是需要多缴纳一定的手续费。